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[1]张〓翔,周峻岗,董俊德,等.红树林土壤微生物模块化聚酮合酶基因(簇)及其多样性研究[J].复旦学报(自然科学版),2015,02:137-147.
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红树林土壤微生物模块化聚酮合酶基因(簇)及其多样性研究(PDF)

《复旦学报》(自然科学版)[ISSN:/CN:]

期数:
2015年02
页码:
137-147
栏目:
出版日期:
2015-04-14

文章信息/Info

Title:
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作者:
张〓翔周峻岗董俊德吕〓红
Author(s):
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关键词:
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Keywords:
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分类号:
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DOI:
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文献标识码:
A
摘要:
聚酮类化合物(Polyketide)是一类重要的具有药用价值的生物活性分子.通过宏基因组学技术获得了红树林土壤微生物中模块化聚酮合酶(Polyketide Synthase, PKS)基因(簇),并对其多样性进行了研究.首先构建了该红树林土壤微生物的16S rDNA文库,初步分析了红树林土壤样本的细菌群落组成,发现许多菌群曾经被报道存在PKS基因簇,约占整个细菌群落的75%.利用相关菌群的PKS酮基合成酶结构域(Ketosynthase, KS)的保守区域序列信息设计简并引物,并构建了KS DNA序列文库.经测序获得131条新型KS序列,该结果表明红树林土壤微生物中蕴含了许多新型的聚酮类化合物合成酶.为了进一步获得聚酮合酶基因(簇),我们通过土壤微生物宏基因组Cosmid文库的构建与筛选,得到了13个属于trans AT PKS,cis AT PKS ,NRPS/PKS Hybrid等类型的聚酮合酶的基因(簇),并通过构建KS序列的系统进化树分析了样本中聚酮合酶的多样性组成.
Abstract:

参考文献/References

备注/Memo

备注/Memo:
更新日期/Last Update: 2015-04-15